Американская биотехнологическая компания Colossal Biosciences показала платформу на базе искусственного интеллекта. Инструмент получил имя GenoMorph и должен ускорить проекты по возвращению вымерших животных. О разработке в среду рассказал портал TechCrunch. Об этом сообщает портал RuSamara.
Система свела воедино трёхмерную морфологию, сравнительную геномику и биологию развития. Её задача — отыскивать гены, пригодные для редактирования, когда генетических данных мало. Сейчас платформу задействовали в работе над додо: по этой птице сохранился только один полный геном. Для сравнения, по мамонту у Colossal есть порядка сотни.
Разница объясняется условиями среды. В тропиках, где обитал додо, ДНК сохраняется хуже, чем в холоде, уточнили в компании. Генеральный директор и соучредитель Colossal Бен Ламм в беседе с TechCrunch заметил, что сравнивать множество геномов учёным обычно позволяет сам материал, но с древней ДНК такой роскоши нет.
В основу GenoMorph легли сведения о развитии кур, уток, перепелов и голубей. Их дополнили генетической информацией и трёхмерными измерениями черепов свыше 70 видов птиц. На разработку ушло больше года. Нейросеть вычисляет, какие участки ДНК активны при формировании клюва и лицевых структур, а затем предсказывает переключатели, придавшие додо узнаваемый облик. Ламм сравнил платформу с картой сокровищ для генома додо: она помогает искать только значимые различия.
Уже выявлено около 2300 перспективных целей для правки ДНК, связанных с лицевым и черепным обликом птицы. Их предстоит проверить в лаборатории. Кроме того, компания сделала систему доставки инструментов редактирования прямо в развивающиеся эмбрионы — через липидные наночастицы. Так влияние изменений на развитие птицы оценивают, не дожидаясь полного цикла размножения. Колония никобарских голубей, ближайших живущих родственников додо, насчитывает 36 особей, а ещё удалось получить ключевые клетки, дающие начало яйцеклеткам и сперматозоидам.
О безопасности Ламм сказал, что подобные технологии нужны для более точной, контролируемой и проверяемой генной инженерии. Сама платформа гены не редактирует — она лишь подсказывает, какие изменения стоит изучать. Основатель XPRIZE Питер Диамандис, инвестор Colossal, объявил о новой венчурной фирме NeoGenesis Capital. Она поддержит компании, применяющие программируемую биологическую платформу Colossal в здравоохранении, сельском хозяйстве и охране природы.