Совместная разработка Института цитологии и генетики СО РАН и НИИ клинической и экспериментальной лимфологии ускоряет обработку снимков меланомы в 10–15 раз. Нейросеть анализирует электронно-микроскопические изображения за две минуты вместо прежних тридцати. Об этом сообщает портал Самара онлайн 24.
Как рассказали в издании СО РАН «Наука в Сибири», предметом изучения стали митохондрии и эндоплазматический ретикулум. Их взаимодействие влияет на клеточную сигнализацию: при нарушении связи опухолевые клетки не получают сигналы к апоптозу, пояснила старший научный сотрудник НИИКЭЛ Юлия Таскаева. Зоны соприкосновения этих структур исследователи считают перспективной мишенью для терапии.
Раньше расшифровка сотен микрофотографий отнимала недели и месяцы. Теперь нейросеть сама распознает нужные органеллы, определяет участки контактов, считает их количество и длину. Через веб-сервис достаточно загрузить снимок — и система выдаст таблицу с расчетами, избавив специалистов от рутины.
Алгоритм обучали на сотнях изображений клеток мышиной меланомы, которую используют как стандартную лабораторную модель. Старший научный сотрудник ИЦиГ СО РАН Михаил Генаев уточнил, что процесс обучения осложняли дефекты снимков, артефакты и размытые границы. Тем не менее авторы добились стабильной работы.
Сейчас нейросеть работает только с меланомой, но в планах — адаптировать ее для других опухолей и биопсий человека. Это позволит применять инструмент в клинической практике. Результаты опубликованы в Journal of Imaging.