Исследователи из Университета Рокфеллера сделали значительный шаг вперед в области микробиологии. Они разработали метод, позволяющий извлечь генетический материал из 99% почвенных бактерий, которые ранее не могли быть культивированы. Технология основана на извлечении ДНК из почвы и последующем использовании нанопорового секвенирования для восстановления полных геномов.
Из одного образца лесной почвы было извлечено 2,5 терабайта генетической информации. Анализ показал наличие сотен ранее неизвестных видов бактерий. Их геномные последовательности были транскрибированы в реальные молекулы благодаря методам синтетической биологии.
На основании этих данных ученые создали два новых антибактериальных препарата:
Эрутацидин, который атакует кардиолипин и разрушает мембраны бактерий.
Тригинтамицин, блокирующий белок ClpX, что является редкой мишенью для антимикробной терапии.
Эта технология является универсальной и может применяться к любым метагеномным образцам, включая морскую экосистему, кишечную микрофлору и экстремальные условия. Открытие предоставляет доступ к неисследованным ресурсам биологического разнообразия и изменяет подход к поиску новых лекарственных средств. Теперь ученые могут анализировать генетический материал без необходимости культивирования микроорганизмов.
Это достижение знаменует новую эпоху в борьбе с антибиотикорезистентностью и способствует более глубокому пониманию "темной материи" микробного мира, пишет источник.