В кишечнике человека выявлены признаки гигантских бактерий

Следы ДНК гигантских бактерий рода Epulopiscium выявили в тысячах человеческих микробиомов. Исследование провела команда Дэнни Ионеску из Технического университета Берлина, препринт выложен на biorxiv.org. Об этом пишет сайт TechInsider.

Сам вид E. fishelsoni впервые описали в Красном море. Его имя увековечивает израильского зоолога Льва Фишельсона. Из-за крупных размеров микроб сначала посчитали простейшим — лишь в 1993 году анализ рРНК доказал, что это бактерия. Размножение у неё необычное: внутри материнской клетки растут дочерние, потом оболочка разрывается. Геном одной клетки представлен десятками тысяч копий.

Обычная бактерия достигает примерно двух микрометров. Гигантскими считают микроорганизмы крупнее 10 микрометров. Они занимают особые ниши — мангровые заросли, кишечник рыб. У рода Epulopiscium длина доходит до 600 микрометров, то есть превышает половину миллиметра. Чаще всего их находят в кишечнике рыб-хирургов. Там они влияют на кислотный баланс и работу пищеварительных ферментов.

Ионеску обратил внимание на последовательности, родственные Epulopiscium, у других рыб. Он решил проверить, насколько широко распространены такие микробы. Вместе с коллегами биолог изучил свыше 600 тысяч образцов микробиома животных из более чем 80 стран. Большая часть данных пришла из открытых баз, некоторые пробы собрала сама команда. Положительных проб оказались десятки тысяч — у моллюсков, хорьков и многих других животных.

Следы Epulopiscium нашли и в тысячах человеческих микробиомов. Чаще всего они попадались у детей до года. Также носителей больше среди пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника и колоректальным раком. По версии Ионеску, микробы не запускают болезнь, а осваиваются при сбое микробного равновесия. В одной клетке может быть от сотен до тысяч хромосом; такое разнообразие помогает выживать в нестабильной среде. Поэтому бактерии могут указывать на проблемы в кишечнике ещё до симптомов.

Биолог Никола Сегата из Университета Тренто напомнил: обнаружение столь крупных микробов у человека стало бы сюрпризом. По его словам, анализ ДНК способен выявить другой микроорганизм с похожими генами — возможно, неизвестный и вовсе не гигантский. Ионеску возражает: даже в этом случае носитель генов, скорее всего, близкий родственник Epulopiscium, устроенный сходным образом. Группа уже ищет микробов флуоресцентными зондами, которые соединяются с найденными участками ДНК. Главным доводом будет сама бактерия, увиденная в микроскоп.