ИИ спроектировал четыре белка, но сработал лишь один из десятков

Исследователи испытали систему Pinal, поручив ей разработать четыре разных белка. В задания вошли флуоресцентный белок, два фермента и компонент крупного многобелкового комплекса. Данную информацию сообщает портал RuSamara.

Схема каждый раз была одинаковой. Сначала система формировала большой набор вариантов, затем компьютерный анализ отсекал менее подходящие, а десятки оставшихся конструкций проверяли в лаборатории.

На примере зелёного флуоресцентного белка GFP, за открытие которого вручили Нобелевскую премию, Pinal сгенерировала 50 тысяч светящихся вариантов. Последовательности, похожие на уже известные флуоресцентные белки, из списка убрали, зато сохранили признаки, важные для работы GFP: бочкообразную структуру и аминокислоту, которую можно химически изменить ради появления свечения.

После компьютерного отбора осталось 29 кандидатов. Все их синтезировали в бактериях E. coli, однако флуоресценцию нашли только у одного белка. С другими типами белков поступали так же: до лаборатории доходили несколько десятков вариантов, а работоспособными оказывались единицы.

Авторы считают, что оценивать итог лишь по доле удачных экспериментов нельзя. Часть перспективных вариантов походила на известные белки GFP и отсеялась ещё при отборе. Не проверяли учёные и конструкции, чья форма заметно отличалась от структуры GFP, — среди них могли остаться альтернативы. Как передаёт Ars Technica, результаты показывают: точности отдельных структурных данных для проектирования белка недостаточно. Даже при малом числе удачных конструкций система выдала новый работающий белок.